Identificación de nuevos genes candidatos

Título: Identificación de nuevos genes candidatos que utilizan redes reguladoras de genes (FIS PI081635)

Duración: 2009-11

Entidad Financiadora: Fondo de Investigaciones de la Seguridad Social, Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Salud de España (FIS)

Investigador Principal: Víctor Moreno

Resumen: Se propone una metodología nueva para identificar nuevos marcadores genéticos de susceptibilidad y/o pronóstico en el cáncer colorrectal. Se basa en el análisis de datos complejos de SNPs, CNV y expresión, combinada con fuentes externas a través de técnicas de biología de sistemas. Las muestras de mucosa y tumor normales de 100 individuos se analizarán para la expresión con microarrays. En los mismos temas, variabilidad genética (SNPs y CNV) utilizando paro analizado 500K chips y en tumores, desequilibrios allelicos con aCGH. Los datos de expresión génica, datos de variación, y otras fuentes de datos externas disponibles como "gene ontology", "pathways" y literatura se combinarán utilizando la teoría de redes para identificar relaciones entre genes.