Diagnóstico molecular del cáncer

Dentro del área del diagnóstico molecular del cáncer, nuestra investigación se orienta hacia la identificación de biomarcadores útiles para el diagnóstico precoz del cáncer colorrectal. Los dominios de interés son la genómica, proteómica y epigenética. Pensamos que las redes de regulación genómica serán útiles para la identificación de nuevos marcadores.

Identificación de nuevos marcadores molceulares de diagnóstico precoz

Nos proponemos identificar nuevos marcadores moleculares de diagnóstico en cáncer colorrectal a partir del análisis complejo de los datos que hemos generado sobre expresión, SNPs, CNV, metilación y microRNAs, analizados mediante técnicas de biología de sistemas. Este proyecto cuenta con financiación del FIS y del 7 º programa marco de la UE. Se han analizado muestras pareadas de mucosa normal y tumor de 100 individuos con cáncer de colon y 50 mucosas de individuos sanos.

Los detalles de este proyecto se encuentran en www.colonomics.org

Identificación de biomarcadores proteómicos para el diagnóstico precoz

Estamos realizando un proyecto de análisis de perfiles proteómicos en suero con el objetivo de identificar marcadores de diagnóstico y pronóstico. Esta metodología ha sido exitosa en otros tumores (ovario, mama, páncreas, próstata) y nuestro grupo tiene el material idóneo para realizar los análisis pues conservamos congelados plasmas de los casos y controles del estudio realizado durante 1996-98. Este proyecto, financiado por el FIS, se realiza en colaboración con la unidad de proteómica de la Universidad de Barcelona (IDIBAPS, Dres O Bachs y JM Estanyol). Hemos analizado los perfiles proteicos con la tecnología MALDI-TOF de muestras purificadas de plasmas de 300 casos y 300 controles. En estos momentos estamos en la fase de análisis bioinformático de estos perfiles para identificar los picos que difieren entre casos y controles. Los picos serán posteriormente analizados para identificar el péptidos o proteínas que contienen y que podrían ser útiles para el diagnóstico precoz del cáncer utilizando muestras de sangre.

Diagnóstico precoz del CCR con marcadores epigenéticos

Estamos estudiado los tumores y la mucosa sana del colon de una serie de 45 casos con microarrays para detectar el estado de metilación de 1500 marcadores epigenéticos en 800 genes relacionados con cáncer. Las comparaciones nos han permitido identificar un conjunto de marcadores epigenéticos que podrían ser útiles para el diagnóstico precoz. En estos momentos se están diseñando los estudios moleculares para evaluar si estos marcadores se encuentran en el ADN extraído de excrementos de personas con cáncer, adenomas y controles sanos. Este estudio se realiza en colaboración con el Dr. Manel Esteller del IDIBELL.