Identificació de nous gens candidats

Títol: Identificació de nous gens candidats que utilitzen xarxes reguladores de gens (FIS PI081635)

Durada: 2009-11

Entitat Finançadora: Fons d'Investigacions de la Seguretat Social, Institut de Salut Carlos III, Ministeri de Salut d'Espanya (FIS)

Investigador Principal: Víctor Moreno

Resum: Es proposa una nova metodologia per identificar nous marcadors genètics de susceptibilitat i/o pronòstic en el càncer colorectal. Es basa en l'anàlisi de dades complexes de SNPs, CNV i expressió, combinada amb fonts externes a través de tècniques de biologia de sistemes. Les mostres de mucosa i tumor normals ajuntades de 100 individus s'analitzaran per a l'expressió amb microarrays. En els mateixos temes, variabilitat genètica (SNPs i CNV) és analitzat utilitzant 500K xips i en tumors, desequilibris allelics amb aCGH. Les dades d'expressió gènica, dades de variació, i unes altres fonts de dades externes disponibles com "gene ontology", "pathways" i literatura seran combinades utilitzant la teoria de xarxes per identificar relacions entre gens.