HiPerDART
HiPerDART
Títol: HiPerDART: Development of High Performance Diagnostic Array Replication Technology for prognostic prediction in colorectal cancer (PS09/01037)
Durada: 2010-12
Entitat Finançadora: Fons d'Investigacions de la Seguretat Social, Institut de Salut Carlos III, Ministeri de Salut Espanyol
Investigador Principal: Víctor Moreno
Resum: El projecte HiPerDART pretén desenvolupar, utilitzant una nova tecnologia d'impressió anomenada SUpramolecular NanoStamping (SUNS), un nivell superior de la tecnologia de microarrays que promet millorar dràsticament la fiabilitat de les proves mèdiques. Aquesta tecnologia es posarà a prova en una aplicació clínica per generar una eina pronòstica i predictiva basada en un ampli conjunt de marcadors genòmics, seleccionats mitjançant tècniques novedoses de bioinformàtica.
Els pacients diagnosticats de càncer colorectal en estadi II es podrien beneficiar d'un perfil molecular que permetés indicar la necessitat de quimioteràpia adjuvant. Inherent a aquest enfocament hi ha la hipòtesi que cada tumor i la mucosa on s'origina contenen signatures amb informació genètica i epigenètica que, en el moment del diagnòstic, pot dirigir el comportament biològic del tumor en l'expressió gènica, l'abundància de microRNAs, les alteracions genètiques en l'ADN (SNP / CNVs / LOH) i la metilació de l'ADN proporcionaran la combinació de biomarcadors més sensibles i específics per identificar aquells pacients amb tumors més agressius que puguin beneficiar-se de quimioteràpia adjuvant. El Projecte HiPerDART utilitzarà dades disponibles sobre expressió i SNPs / CNVs per desenvolupar als predictors.
Ens proposem ampliar els dominis de les dades genètiques en la metilació de l'ADN i perfils de microRNA per millorar l'exactitud de la predicció. El perfil obtingut s'implementarà en un microarray SUNS i serà validat en una amplia mostra independent de tumors colorectals. S'utilitzaran eines de biologia de sistemes com la modelització de les xarxes per entendre les relacions entre l'expressió genètica i epigenètica i els seus reguladors (metilació de l'ADN i els microRNAs).
