Diagnòstic molecular del càncer

Dins l’àrea del diagnòstic molecular del càncer, la nostra recerca s’orienta cap a la identificació de biomarcadors utils pel diagnòstic precoç del càncer colorectal. Els dominis d'interès son la genómica, proteómica i epigenètica. Pensem que les xarxes de regulació genòmica seran útils per la identificació de nous marcadors.

Identificació de nous marcadors moleculars de diagnòstic precoç.

Ens proposem identificar nous marcadors moleculars de diagnòstic del càncer colorectal a partir de l'anàlisi complex de les dades que hem recopilat sobre expressió, SNPs, CNV, metilació i microRNAs, analitzades mitjançant tècniques de biologia de sistemes. Aquest projecte conta amb finançament del FIS i del 7é programa marc de la UE. Hem analitzat en 100 individus amb càncer i 50 controls sans.

Els detalls d'aquest projecte es troben a www.colonomics.org

Identificació de biomarcadors proteòmics pel diagnòstic precoç

Estem realitzant un projecte d’anàlisi de perfils proteòmics en sèrum amb l'objectiu d'identificar marcadors de diagnòstic i pronòstic. Aquesta metodologia ha estat exitosa en d'altres tumors (ovari, mama, pàncrees, pròstata) i el nostre grup té el material idoni per realitzar les anàlisis doncs conservem congelats plasmes dels casos i controls de l'estudi realitzat durant 1996-98. Aquest projecte, finançat per el FIS, es realitza en col·laboració amb la unitat de proteòmica de la Universitat de Barcelona (IDIBAPS, Drs O Bachs i JM Estanyol). Hem analitzat els perfils protèics amb la tecnologia MALDI-TOF de mostres purificades de plasmes de 300 casos i 300 controls. En aquests moments estem en la fase d’anàlisi bioinformàtic d’aquests perfils per identificar els pics que difereixen entre casos i controls. Els pics seran posteriorment analitzats per identificar el pèptids o proteïnes que contenen i que podrien ser útils per el diagnòstic precoç del càncer utilitzant mostres de sang. 

Diagnòstic precoç del CCR amb marcadors epigenètics.

Estem estudiant els tumors i la mucosa sana del còlon d’una sèrie de 45 casos amb microarrays per detectar el estat de metilació de 1500 marcadors epigenètics en 800 gens relacionats amb càncer. Les comparacions ens han permés identificar un conjunt de marcadors epigenètics que podrien ser útils per el diagnòstic precoç. En aquets moments, s’estan dissenyant els estudis moleculars per avaluar si aquets marcadors es troben en l’ADN extret de femtes de persones amb càncer, adenomes i controls sans. Aquest estudi es realitza en col·laboració amb el Dr. Manel Esteller de l’IDIBELL.